El Comité Científico es el órgano asesor encargado de orientar el rumbo que debe tomar la Fundación IDEAS en sus líneas prioritarias de investigación y actuación.

Las personas que lo componen son expertos, tantos nacionales como internacionales, de reconocido prestigio en sus ámbitos de trabajo e investigación. Entre sus miembros se encuentran tres premios Nobel y un premio Príncipe de Asturias.

Sus reuniones se producen con carácter bianual. Desde la puesta en marcha de la Fundación IDEAS a finales de 2008, se han producido dos reuniones del Comité Científico, en julio de 2009 y de 2011.